דרך אחרת לספק הנפשת Web היא דרך שפת התכנות המוכרת Java, המתאימה לבניית תוכנה שעובדת עם אינטרנט. Java פועלת על כל מערכות ההפעלה ואפשר לבנות באמצעותה תוכניות שירוצו באותו אופן על Windows ,MacOS או Java .UNIX נחשבת לשפה חזקה, גמישה ואוניברסאלית - ביכולתה לרוץ בדפדפני רשת, אך ניתן להורידה מהרשת ולהריץ אותה במחשב המקומי של המשתמש.
Java משמשת ליצירת מגוון גדול של תוכנות התומכות במנשק גרפי ומאפשרת קישוריות למסד נתונים בשרת. כמו כן, שפה זו שימושית לתצוגת חדשות, מניות והדמיות תוך שליטה מלאה במה שיוצג בחלון.
יישומוני Java הם יישומים קטנים (Applets) שנכתבים בשפת תכנות Java ונעשה בהם שימוש בדפי Web. מתוך מגוון הדברים שמעצבי אתרים עושים עם יישומונים אלו, אחד מהיישומים הפופולאריים ביותר הוא הנפשה. יישומוני Java יכולים להפיח רוח חיים בעמוד Web, לגרום להידודיות רבה יותר באתר, כל זאת ע"י הוספת הנפשה. למשל, הדמיית מערכת השמש, משחק הידודי או שימוש עסקי כמו כלי גיליון אלקטרוני. Java הינה בעלת עוצמה רבה יותר מ-DHTML, השפה המשמשת ליצירת עמודי Web דינמיים.
יישומוני Java מספקים אומנם יותר פונקציונאליות מאשר DHTML, אך הם גם לא נחשבים לפתרון פלא - יישומונים כאלו יכולים להכביד על רשת התקשורת. לכן, כדאי להשתמש ביישומוני Java כאשר יש צורך במנשק משתמש יותר גרפי ויותר עשיר, אחרת עדיף להשתמש
ב-DHTML, שהיא יותר קלה ומהירה מיישומוני Java.
כיום, מעצבי אתרים פחות נוטים להוסיף הנפשה אלא אם הדגש בדף ה-Web הוא על ההנפשה, מכיוון שזה לוקח הרבה זמן למשתמשי הקצה להוריד יישומון Java כזה.